以孔孟为代表的儒家思想，在大力宣扬“仁者爱人”的忠恕之道的同时，强调“仁”的实行要以“礼”为规范，提倡德治和教化，反对苛政和任意刑杀;并有“不患寡而患不均，不患贫而患不安”的治国理念。儒家重视人们良好的德行，倡导忠孝、正直和完整的人格。这些思想形成儒家以中庸为核心的思想文化体系，并营造了影响人类文化数千年的东方文化圈。孔子重视民生疾苦，呼唤仁政，银杏文化也多方面体现出儒家中庸之温、良、恭、俭、让的精神。儒家思想强调对真、善、美的关怀与体认，每个人都有责任在自然生命的行程中，提升心灵的意境。儒家教育人们万一国家混乱无道时，不能放弃平生志节。正如银杏之亘古孑遗，逾亿万年而秉性不改，固守莽莽神州。儒家文化中的道德观与银杏千百年来体现的绿色、健康、奉献等美德相互融合。在一些著作中，银杏树被看作儒家的象征。据说孔子很喜欢在银杏树下阅读和教授弟子，后人将他教诲弟子的地方称为“杏坛”，至今在山东曲阜孔庙诗礼堂前还生长着宋代所植雌雄银杏树各一株以示纪念。连在衢州的孔氏南宗家庙正门前，也植有两排高大古老的银杏树。孔子的女婿公冶长在山东安丘的读书处，至今仍生长着一雄一雌两株参天银杏，传为孔子看望女婿时带去树苗，公冶长亲手所植。 在行为规范方面，儒家的一种主张可以归纳为“时禁”，其在理论上的支持，主要是“天人合一”、人与自然和谐的精神。古代儒家学说不是普遍地禁止或地非议杀生猎兽或伐树，而是倡导取物有节，合理利用资源，其要义不是完全的禁欲，而是节制人类的欲望。《大戴礼记》亦记载孔子说：“方长不折则恕也，恕当仁也。”这种对待树木的惜生不随意杀生的“时禁”与儒家主要道德理念孝、恕、仁紧密联系，意味着对自然的态度与对人的态度不可分离。可见，作为长期占据中国封建社会主导思想地位的儒家学说，无论从精神上，还是从行为上，都对古银杏资源的保护及其文化的传承起到了至关重要的作用。